一般而言，硅藻土在生长过程中，不断地吸收水中的游离硅，形成坚固而多孔的细胞壁，硅藻生命周期结束后，细胞壁不会分解，沉积到水底，经过地壳变迁形成了硅藻土。优质土主要集中于吉林省长白山区域，约占全国的2/3，其他矿床大多数为3~4级土，由于杂质含量高，不能直接深加工利用。
硅藻土的主要矿物成分为蛋白石，在电子显微镜下像蜂窝，松散密度为0.3-0.5g/cm3,莫氏硬度为1~1.5，是热、电、声的不良导体，熔点在1300°C以上，化学稳定性高。具有多孔性、不可压缩性和稳定性，其孔隙率可达90%以上，是活性炭的5000-6000倍，正是这种突出的分子筛结构，决定了其具有极强的物理吸附性能和离子交换性能。
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