硅藻土的用途是做功能填料，主要应用于涂料、塑料、橡胶、医药、造纸、磨料、精密铸件和微孔陶瓷等。硅藻土做油漆涂料的填料能够改善产品的稳定性、弹性、分散性等，提高产品的强度、耐磨和耐酸性。硅藻土作为功能性填料，还可以起到消光的作用。如在硅橡胶中加入硅藻土，可使橡胶耐油和耐热性增强，并改善加工性能。
用硅藻土做填料生产纸板，节省纸浆20%，不仅降低了生产成本，而且纸板的关洁度、强度都得到了提高。 将优质硅藻土填加到汽车制动器衬片和机械工业用石棉摩擦片中，它与树脂及其它物料极易结合，与橡胶油特殊的结合性，既有填充作用，又有补强作用，并能克服产品热衰退性能，增强产品的适应性。 硅藻土本身就具有大量微孔，因此制备微孔陶瓷膜管的好填料。有人用优质精选硅藻土做填料，成功地开发出硅藻土微孔陶瓷膜管。
